Tout commence dans un petit village appelé rizenbul. Un jour en rentrant chez eux, edward ( 10 ans ) et alphonse ( 9 ans ) ELRIC trouvent leur mère, Trisha, étendu sur le sol, gravement malade. Le médecin leur révèle que cela devait faire longtemps qu'elle souffrait en silence. Les deux jeunes garçons comprennent alors que cela est due à l'absence de leur père, Hohenheim, qui les a abandonnés.
Il faut savoir que leur père était alchemist d'état, c'est-à-dire, un alchemist au service de l'armée, et que durant son absence, Trisha a due élevé seule ses enfants. Un jour, ceux-ci trouvèrent un des livres de leur père traitant d'alchimie. Très vite, ils se passionnent pour cette science qui leur donne l'impression d'être des magiciens. Du fait de leur hérédité, ils sont par ailleurs très doué.
Cependant, très inquiets pour leur mère, ils décident d'envoyer une lettre à chaque personne ayant connu leur père de façon à le faire revenir et ainsi sauver leur mère. Hélas personne ne vint et Trisha mourut, ses dernière pensées allant vers son mari qu'elle n'avait jamais cessé d'aimer.
Nos deux héros se retrouvent donc seuls mais pas totalement puisque leur voisine, Pinako ROCKBELL, et la petite fille de celle-ci, Winry, s'occupèrent d'eux.
Un jour de violent orage, les garçons décident de partir aider les hommes du village à consolider la digue grâce à l'alchimie. Mais cela échoue. Quand soudain arrive une femme qui grâce à l'alchimie réussit à élever une haute muraille. Ce qui éblouit nos jeunes alchemists, de plus cette femme l'a fait sans cercle de transmutation ! Par la suite, il vont demander à cette femme, apppelée Izumi, de leur apprendre l'alchimie. Ce qu'elle fera pendant 1 an.
Nous nous retrouvons donc en 1910, et edward (ed) et alphonse (al) rentrent à rizenbul sans prévenir personne car depuis la mort de leur mère, ils n'avaient qu'une idée en tête, la ramener à la vie grâce à l'alchimie, ce qui est formellement interdit.
Hélas, ce qu'ils avaient entreprit échoue entrainent un autre drame car dans la transmutation ed perd une jambe mais c'est le corps entier de al qui est aspiré. Ed parvient tout juste à encrer l'ame de son frère dans une armure qui se trouvait à proximité au sacrifice son bras. Al se réveille donc dans un corps qui n'est pas le sien et voit se qui est arrivé à son frère. Il décide de l'emmener chez leur voisine pour le soigner. Un alchemist d'état du nom de Roy MUSTANG voit tout de loin. En effet, il était l'un des destinataires des lettres des deux garçons et était venu à rizenbul pour questionner les garçons à propos de leur père recherché par l'armée. Cependant, il semble désormais beaucoup plus interressé par les garçons auquels il proposent de devenir alchemist d'état avant de repartir à central, la capital. Ed lui demande à mamy pinako et à winry de lui installer deux méca-greffes en remplacement des membres qu'il a perdu.
Ceci fait, lui est son frère décident de partir pour central afin de rencontrer ce Roy MUSTANG et devenir alchemist d'état.



